Standardní kultivace – průkaz nejčastějších bakteriálních původců infekcí HCD. Předběžný masivní nález patogenů za 24 – 48 hodin, definitivní nálezy za 2 – 3 dny.
Přehled patogenů HCD:
Speciální kultivace – požadavek na tato vyšetření je nutné vyznačit na žádance, trvání vyšetření je delší.
Patogeny HCD vyžadující speciální kultivaci:
Standardní kultivace – průkaz většiny bakteriálních původců gastrointestinálních onemocnění. Negativní nálezy za 2 dny, pozitivní nálezy (patogen GIT) za 2 – 4 dny.
Přehled prokazovaných patogenů GIT:
Speciální kultivace – toto vyšetření je nutno telefonicky domluvit v naší laboratoři:
Nálezy signifikantní bakteriurie (včetně doporučení ATB terapie pro vykultivovanou skupinu bakterií) a negativní nálezy za 24 hodin. Definitivní nálezy s antibiogramy za 2-3 dny.
Nálezy bakterií v moči jsou kvantifikovány:
| Signifikantní bakteriurie | >100 000 bakterií/ml |
| Suspektní bakteriurie | <100 000 bakterií/ml (vyšetření je vhodné zopakovat) |
| Signifikantní bakteriurie – kojenci | >10 000 bakterií/ml |
| Suspektní bakteriurie – kojenci | <10 000 bakterií/ml |
Komunitní pneumonie – kultivační vyšetření spůta , bronchoalveolární laváže, nebo aspirátu. Materiál je zpracován také mikroskopicky pro posouzení úspěšnosti odběru (stupeň kontaminace flórou dutiny ústní).
Průkaz většiny bakteriálních patogenů dolních dýchacích cest:
Nosokomiální pneumonie – kultivační vyšetření spůta , bronchoalveolární laváže, nebo aspirátu, případně tracheální kanyly. Toto vyšetření slouží k průkazu nosokomiálních původců pneumonií, u dlouhodobě hospitalizovaných pacientů na ARO a JIP ke sledování kolonizace sliznic a kanyl nosokomiálními kmeny bakterií.
Nejčastější nosokomiální agens:
Legionellová pneumonie – vyšetření provádíme průkazem antigenu v moči
Atypické pneumonie způsobené Mycoplasma pneumoniae a Chlamydia pneumoniae se vyšetřují sérologicky.
Hemokultury – rychlá diagnostika běžných bakterií (Enterobaktérie, stafalokoky, streptokoky,…). Záchyt růstu už za 24 hodin, telefonické hlášení mikroskopického nálezu, předběžná citlivost už za 36 hodin. Naše hemokultury umožňují růst i náročných mikrobů (Neisseria meningitidis, hemofily, nutričně deficitní streptokoky, anaeroby,…). Záchyt těchto mikrobů trvá déle (2 – 7 dní).
Katetrové sepse – pacienti s dlouhodobě zavedeným intravenózním katetrem (cca 5 - 7 dní) se známkami sepse. Kvantitativní vyšetření provádíme z vyjmutých i.v. katetrů.
Kvantifikace bakterií osídlujících katetr:
| Suspektní katetrová sepse | >15 CFU (colony forming unit ® počet životaschopných bakterií na 5 cm dlouhém žilním katetru). |
| Nepravděpodobná katetrová sepse | <15 CFU |
Kultivační metody - zaslaný nativní mozkomíšní mok je zpracován mikroskopicky. Dále je provedena kultivace zachycující většinu patogenů vyvolávajících purulentní meningitidy. V případě odběru v nočních hodinách a o svátcích je možné mozkomíšní mok naočkovat do lahviček na hemokultury.
Etiologická agens bakteriálních meningitid se výrazně liší podle věku:
| Novorozenci: | Streptococcus agalactiae (50%) Enterobacteriaceae (30%) Listeria monocytogenes (10%) |
| Kojenci a batolata: | Haemophilus influenzae (70%) Neisseria meningitidis (10%) |
| Starší děti a mladí dospělí: | Neisseria meningitidis (40%) Streptococcus pneumoniae (20%) |
| Dospělí: | Streptococcus pneumoniae (20%) |
| Starší (nad 60 let): | Streptococcus pneumoniae (50%) Listeria monocytogenes (15%) |
Latexová aglutinace – u purulentního mozkomíšního moku provádíme expresní průkaz antigenů latexovou aglutinací.
Jedná se o průkaz nejčastějších bakteriálních agens purulentních meningitid:
Tyto materiály se zpracovávají individuálně podle lokality odběru, diagnózy a věku pacienta. U stěrů a výtěrů neprovádíme mikroskopické vyšetření.
Tekutý materiál se zpracovává individuálně podle lokality odběru, diagnózy a věku pacienta. Kousky tkání jsou nejprve homogenizovány a potom zpracovány jako tekutý materiál. Součástí těchto vyšetření je mikroskopie.
Kultivace některých bakterií je velmi obtížná až nemožná, u některých je velmi malá záchytnost z kultivace, správný odběr některých bakterií je velmi obtěžující nebo i invazivní. Z těchto důvodů se uplatnily v bakteriologii tzv. „bezkultivační metody“. Jedná se o přímý průkaz specifického antigenu nebo specifického úseku DNA. Na našem pracovišti používáme obě metody:
Průkaz antigenu
Průkaz DNA
K diagnostice onemocnění způsobených bakteriemi se na našem pracovišti používá i nepřímého průkazu – detekce specifických protilátek.
Spektrum vyšetření protilátek proti bakteriím:
U většiny vykultivovaných bakterií vyšetřujeme také citlivost na antibiotika a chemoterapeutika. Sestavy vyšetřených antibiotik se řídí: